Cơ cấu tổ chức của Viện bao gồm:
- Hội đồng tư vấn
- Ban lãnh đạo Viện
PGS. TS. Nguyễn Ngọc Hà Viện trưởng 
PGS. TS. Trần Thị Ngọc Quyên Phó Viện trưởng - Ban Nghiên cứu và Đào tạo
ThS. Phùng Bảo Ngọc Vân Nghiên cứu viên - Ban Hợp tác và Chuyển giao
TS. Phùng Thị Yến Trưởng ban Hợp tác và Chuyển giao - Các nghiên cứu viên liên kết
- Chuyên viên
- Đội ngũ cộng tác viên
